中 華 民 國 海 巡
圖：海巡勤務封面 民國89年（2000）1月28日啟用 2：3 國徽象徵效忠中華民國，保護疆域之意涵；金黃色警鴿象徵警戒、和平、效率；金黃色法龍象徵保護疆域，捍衛沿海，維護人民安全；白色天秤象徵公平。
海巡各單位旗為海巡旗旗桿側鑲上一條白布，白布內以黑字書寫單位名稱。 署長旗
分署長旗
南沙指揮官旗
單位旗
警艇旗
規定於民國18年（1929）的《各項船舶旗幟圖》。民國38年（1949）政府遷臺後許多海上維安機構皆暫停運作，警艇旗也不再使用。
護漁巡艦及漁業調查試驗等船旗幟
規定於民國24年（1935）4月10日國民政府公報第一七一二號。可能與警艇旗在同一時期停用。
|
2：3 
2：3 （不含絲穗） 
2：3 
2：3